Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms