Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms