Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHANK2Q9UPX8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms