Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
L1RE1Q9UN81 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
L1RE1Q9UN81 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms