Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH3Q9UHC1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms