Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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