Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms