Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD5Q9P267 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms