Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms