Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms