Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms