Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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UBQLN4Q9NRR5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
UBQLN4Q9NRR5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
UBQLN4Q9NRR5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
UBQLN4Q9NRR5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
UBQLN4Q9NRR5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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