Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A20Q9NP91 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A20Q9NP91 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A20Q9NP91 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC6A20Q9NP91 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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