Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF17Q9BXT8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms