Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms