Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms