Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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KCNS3Q9BQ31 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNS3Q9BQ31 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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