Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms