Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGAP1Q96PV0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms