Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms