Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms