Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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