Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms