Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG4Q92954 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms