Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms