Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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