Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCSAMQ8N6F7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms