Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNMB4Q86W47 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms