Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HAPLN4Q86UW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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