Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRCQ7RTU9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRCQ7RTU9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms