Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP34Q70CQ2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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