Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms