Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms