Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms