Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PERM1Q5SV97 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms