Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AP001993.1-201ENST00000527317 2337 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms