Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms