Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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