Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC57Q2TAC2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms