Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL24A1Q17RW2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL24A1Q17RW2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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