Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA9Q16795 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms