Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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