Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRF1Q16656 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms