Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms