Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITSN1Q15811 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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