Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms