Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms