Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLD3Q15054 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms