Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC3Q15034 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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