Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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